Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms