Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHRF1Q9P1Y6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms