Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23BQ9NYZ1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms