Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms