Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms