Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms