Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms