Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3GQ9NS98 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3GQ9NS98 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms