Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLE4Q9NR33 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms