Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms