Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms