Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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