Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms