Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLDIP3Q9BY77 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms