Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms