Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms