Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3Q9BXJ4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms