Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms