Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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