Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTKNQ9BST9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms