Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
C2orf88Q9BSF0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C2orf88Q9BSF0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms