Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms