Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms