Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms