Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms