Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC2Q96PR1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC2Q96PR1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms