Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms