Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms