Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms