Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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