Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VCPIP1Q96JH7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms