Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms