Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms