Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms