Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms