Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EDAQ92838 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EDAQ92838 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms