Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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RABGGTAQ92696 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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