Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms