Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ2

HPSE2, Inactive heparanase-2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSE2Q8WWQ2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPSE2Q8WWQ2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPSE2Q8WWQ2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPSE2Q8WWQ2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPSE2Q8WWQ2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPSE2Q8WWQ2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPSE2Q8WWQ2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPSE2Q8WWQ2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPSE2Q8WWQ2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPSE2Q8WWQ2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms