Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHIPQ8WWQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHIPQ8WWQ0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms