Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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