Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCOLN3Q8TDD5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms