Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms