Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF439Q8NDP4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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