Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD53Q8N9V6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms