Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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SMIM20Q8N5G0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM20Q8N5G0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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