Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC71Q8IV32 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms