Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SETXQ7Z333 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SETXQ7Z333 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SETXQ7Z333 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms