Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms