Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms